Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms