Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms