Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms