Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pop5Q9DB28 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms