Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmd12Q9D8W5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmd12Q9D8W5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms