Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx20Q9D2Y5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms