Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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Zbed3Q9D0L1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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