Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim13Q9CYB0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Trim13Q9CYB0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Trim13Q9CYB0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Trim13Q9CYB0 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim13Q9CYB0 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim13Q9CYB0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim13Q9CYB0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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