Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PmpcbQ9CXT8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms