Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atxn3Q9CVD2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atxn3Q9CVD2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atxn3Q9CVD2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atxn3Q9CVD2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atxn3Q9CVD2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn3Q9CVD2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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