Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Chmp3Q9CQ10 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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