Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rims1Q99NE5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rims1Q99NE5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rims1Q99NE5 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rims1Q99NE5 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rims1Q99NE5 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rims1Q99NE5 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms