Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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