Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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