Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pkn3Q8K045 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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