Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TwnkQ8CIW5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TwnkQ8CIW5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TwnkQ8CIW5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TwnkQ8CIW5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TwnkQ8CIW5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TwnkQ8CIW5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TwnkQ8CIW5 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms