Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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