Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbm28Q8CGC6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms