Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup88Q8CEC0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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