Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Vwc2Q8C8N3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Vwc2Q8C8N3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Vwc2Q8C8N3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vwc2Q8C8N3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vwc2Q8C8N3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vwc2Q8C8N3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vwc2Q8C8N3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms