Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ssuh2Q8C3L1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ssuh2Q8C3L1 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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