Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cldn34b1-201ENSMUST00000096852 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm6853-201ENSMUST00000211160 1041 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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