Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ubash3bQ8BGG7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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