Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms