Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Clec18aQ7TSQ1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms