Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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