Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RgmaQ6PCX7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RgmaQ6PCX7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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