Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp49Q6P9L4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp49Q6P9L4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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