Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l2Q6KAU8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms