Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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