Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms