Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms