Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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