Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms