Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fchsd2Q3USJ8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms