Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms