Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp30Q3UN04 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp30Q3UN04 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp30Q3UN04 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp30Q3UN04 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp30Q3UN04 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp30Q3UN04 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp30Q3UN04 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usp30Q3UN04 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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