Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms