Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Q3U6N9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Q3U6N9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Q3U6N9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Q3U6N9 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Q3U6N9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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