Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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