Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rnf149Q3U2C5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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