Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc9Q3U0M1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms