Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms