Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms