Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm7933-201ENSMUST00000191215 2255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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