Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cyp2c44-201ENSMUST00000026211 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Metap2-210ENSMUST00000181217 1984 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm26953-205ENSMUST00000212599 1435 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cyp19a1-201ENSMUST00000034811 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm9430-201ENSMUST00000121232 1527 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms