Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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