Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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