Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms