Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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